W systemie KSeF od strony technicznej funkcjonują dwa tryby wystawiania faktur: tryb ONLINE i tryb OFFLINE. Tryb ONLINE to wystawianie faktury (wysyłka pliku XML faktury) w czasie rzeczywistym do KSeF. Natomiast tryb OFFLINE sprowadza się natomiast do wystawienia faktury poza KSeF i dosłaniu jej później do systemu w określonym ustawowo terminie, celem nadania jej numeru KSeF.